Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2J2Q9GZM3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2J2Q9GZM3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms