Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ASXL3Q9C0F0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms