Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms