Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
GABARAPL3Q9BY60 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms