Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SRRTQ9BXP5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms