Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BRIP1Q9BX63 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms