Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMAD5Q99717 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms