Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SNX18Q96RF0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms