Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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