Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COG3Q96JB2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms