Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCARF2Q96GP6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms