Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CPNE2Q96FN4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms