Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C18orf8Q96DM3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C18orf8Q96DM3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms