Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
RPUSD4Q96CM3 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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