Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUNDC1Q96C34 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms