Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-218ENST00000551127 2975 ntTSL 213.6□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NAT10-207ENST00000532503 556 ntTSL 413.59□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 213.57□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.57□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LMNA-210ENST00000469565 591 ntTSL 413.53□□□□□ -0.247e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-205ENST00000588693 913 ntTSL 513.48□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.257e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP1R10-201ENST00000376511 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEMT-205ENST00000421096 662 ntTSL 313.45□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-212ENST00000480274 567 ntTSL 513.45□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-209ENST00000538420 572 ntTSL 413.44□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 213.44□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 513.43□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-202ENST00000595565 868 ntTSL 313.39□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-228ENST00000590248 730 ntTSL 213.34□□□□□ -0.277e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-214ENST00000514733 919 ntTSL 313.3□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 DMWD-203ENST00000537879 843 ntTSL 1 (best)13.26□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TIMM44-204ENST00000595876 1206 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GCAT-206ENST00000451984 716 ntTSL 313.23□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP002360.1-203ENST00000321844 5363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-235ENST00000640104 2776 ntTSL 513.21□□□□□ -0.297e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 SPIN3-221ENST00000639418 2860 ntTSL 513.12□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDAH1-201ENST00000284031 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.327e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.347e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 TBC1D31-201ENST00000287380 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.377e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 NT5DC2-208ENST00000471522 582 ntTSL 312.67□□□□□ -0.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.387e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TNRC6A-211ENST00000566108 454 ntTSL 312.64□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEK6-202ENST00000373596 758 ntTSL 312.62□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 UNK-204ENST00000587501 984 ntTSL 1 (best)12.6□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ACSS2-209ENST00000475459 558 ntTSL 412.6□□□□□ -0.397e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-243ENST00000640717 3001 ntTSL 512.58□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 312.55□□□□□ -0.41e-10■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRDM15-215ENST00000495217 703 ntTSL 312.53□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP4R1-202ENST00000400555 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC12.51□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RPUSD3-203ENST00000423108 756 ntTSL 212.5□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CLIC4-202ENST00000488683 2723 ntTSL 212.49□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CREBRF-203ENST00000520420 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPFIA4-211ENST00000600426 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.48□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSD2-216ENST00000507820 528 ntTSL 512.47□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EXOC7-205ENST00000405575 2208 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-201ENST00000321256 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AGTRAP-213ENST00000513739 566 ntTSL 312.44□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.427e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM33-204ENST00000392755 552 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.32□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-215ENST00000638873 3221 ntTSL 212.32□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 27.5
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