Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
UTP4Q969X6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms