Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2E3Q969T4 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2E3Q969T4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms