Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
HLA-CQ95604 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HLA-CQ95604 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms