Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms