Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FRAT1Q92837 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FRAT1Q92837 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms