Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC9Q8TBE3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms