Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C9orf43Q8TAL5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms