Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CLNKQ7Z7G1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms