Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NUP54Q7Z3B4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NUP54Q7Z3B4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms