Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUFY3Q7L099 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUFY3Q7L099 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUFY3Q7L099 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUFY3Q7L099 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUFY3Q7L099 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUFY3Q7L099 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms