Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FAM47EQ6ZV65 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms