Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00299Q6ZSB3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00299Q6ZSB3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms