Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMARCD3Q6STE5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms