Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ZBED9Q6R2W3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZBED9Q6R2W3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms