Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MED27Q6P2C8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MED27Q6P2C8 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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