Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RIF1Q5UIP0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms