Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDCA8Q53HL2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms