Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KLHL12Q53G59 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms