Protein–RNA interactions for Protein: Q52LG2

KRTAP13-2, Keratin-associated protein 13-2, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-2Q52LG2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
KRTAP13-2Q52LG2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms