Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIN52Q52LA3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIN52Q52LA3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms