Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms