Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NBPF8Q3BBV2 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBPF8Q3BBV2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms