Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC96Q2M329 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC96Q2M329 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms