Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM187BQ17R55 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM187BQ17R55 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms