Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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PTPRNQ16849 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTPRNQ16849 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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