Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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HIST2H2BEQ16778 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HIST2H2BEQ16778 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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