Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ATP2B3Q16720 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP2B3Q16720 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms