Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GABRA6Q16445 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA6Q16445 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA6Q16445 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA6Q16445 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA6Q16445 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GABRA6Q16445 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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GABRA6Q16445 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GABRA6Q16445 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GABRA6Q16445 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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