Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TAF1AQ15573 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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