Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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PCM1Q15154 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCM1Q15154 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCM1Q15154 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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