Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL9A3Q14050 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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