Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CUL1Q13616 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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