Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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TCIRG1Q13488 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TCIRG1Q13488 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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