Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ITGB3BPQ13352 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms